MicrobioSee: 基于Web的微生物學(xué)多組學(xué)可視化工具

隨著高通量測序技術(shù)的升級和發(fā)展,可以低成本獲得多組學(xué)數(shù)據(jù)。然而,用于微生物多組學(xué)數(shù)據(jù)分析的繪圖工具無法滿足數(shù)據(jù)描述的需求,并導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)生物學(xué)領(lǐng)域研究人員的高學(xué)習(xí)成本,復(fù)雜的依賴性和高費(fèi)用。因此,為多組學(xué)數(shù)據(jù)開發(fā)工具包對于微生物學(xué)家節(jié)省精力至關(guān)重要。在這項(xiàng)工作中,我們開發(fā)了MicrobioSee,這是一種基于網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的實(shí)時(shí)交互式可視化工具,可以可視化微生物多組學(xué)數(shù)據(jù)。它包括圍繞微生物的主要組學(xué)數(shù)據(jù)的17個(gè)模塊,例如轉(zhuǎn)錄組,宏基因組和蛋白質(zhì)組。使用MicrobioSee,繪圖方法在多組學(xué)研究中得到了簡化,例如多樣性,ROC和DEG富集途徑的可視化。隨后,選取了3個(gè)案例研究來代表微生物學(xué)檢測的功能應(yīng)用。總體而言,我們?yōu)檠芯咳藛T提供了一個(gè)簡潔的工具包以及用戶友好,省時(shí),跨平臺和源打開,特別是沒有編碼經(jīng)驗(yàn)的微生物學(xué)家。在?https://microbiosee.gxu.edu.cn?免費(fèi)提供。

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